MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 7083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015697	TAAT	2	8	1150	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015697	A	7	7	1207	1213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015697	AAG	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015697	ATA	2	6	1416	1421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015697	CCA	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015697	ACT	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015697	AT	3	6	1589	1594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015697	ATT	2	6	1613	1618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015697	TTA	2	6	1637	1642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015697	ATA	2	6	1643	1648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015697	T	7	7	1676	1682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015697	T	6	6	1685	1690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015697	TAT	3	9	1706	1714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015697	A	6	6	1746	1751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015697	TCC	2	6	2552	2557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015697	TTC	2	6	11058	11063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015697	AAT	2	6	11088	11093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015697	AT	3	6	11106	11111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015697	AATGAT	2	12	11116	11127	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015697	ATT	2	6	11667	11672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015697	AAAAT	2	10	11702	11711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015697	ATC	2	6	11717	11722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015697	T	7	7	11761	11767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015697	TAT	2	6	11788	11793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015697	TTAAA	2	10	11822	11831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015697	TAAT	2	8	11844	11851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015697	AAT	2	6	11865	11870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015697	TTA	2	6	11880	11885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015697	AG	3	6	11968	11973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015697	T	7	7	13158	13164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015697	GGA	2	6	13167	13172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015697	T	7	7	13366	13372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015697	A	6	6	13377	13382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015697	CAAT	2	8	13410	13417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015697	CAC	2	6	13419	13424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015697	AAG	2	6	13436	13441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015697	ACA	2	6	14769	14774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015697	T	7	7	14803	14809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015697	ATA	2	6	14812	14817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015697	A	6	6	14832	14837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015697	TTTTA	2	10	14866	14875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015697	TCA	2	6	16680	16685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015697	T	6	6	16713	16718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015697	TTG	2	6	16772	16777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015697	ATC	2	6	16778	16783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015697	GAA	2	6	16797	16802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015697	T	6	6	16826	16831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015697	ATC	2	6	16871	16876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015697	T	7	7	17299	17305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015697	TAT	2	6	17339	17344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015697	TTC	2	6	17368	17373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015697	T	6	6	17407	17412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015697	TCT	2	6	17431	17436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015697	CTA	2	6	17455	17460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015697	TCA	2	6	17462	17467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015697	ATT	2	6	17522	17527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015697	TGT	2	6	17627	17632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015697	GAA	2	6	18575	18580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015697	TTA	2	6	19234	19239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015697	TAA	2	6	19316	19321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015697	TAT	2	6	20282	20287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015697	TCT	2	6	20289	20294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015697	TA	3	6	20295	20300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015697	T	6	6	29064	29069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015697	ACC	2	6	29074	29079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015697	AGTA	2	8	29114	29121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015697	TATG	2	8	29144	29151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015697	TGA	2	6	29203	29208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015697	AAG	2	6	29209	29214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015697	T	7	7	32105	32111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015697	A	6	6	32116	32121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015697	CAAT	2	8	32149	32156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015697	CAC	2	6	32158	32163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015697	AAG	2	6	32175	32180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015697	AAC	2	6	32444	32449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015697	TAC	2	6	32472	32477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015697	AAATC	2	10	32535	32544	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015697	TCAAT	2	10	33540	33549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015697	CCG	2	6	33567	33572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015697	CGTA	2	8	33583	33590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015697	GGT	2	6	33592	33597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015697	TAT	2	6	34940	34945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015697	TAC	2	6	34976	34981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015697	ATC	2	6	35013	35018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015697	ACT	2	6	35065	35070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015697	GCC	2	6	35081	35086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_015697	AGG	2	6	35274	35279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015697	TTA	2	6	36641	36646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015697	AAAT	2	8	36661	36668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015697	AAC	2	6	36705	36710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015697	TC	3	6	36713	36718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015697	GAA	2	6	36754	36759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015697	T	7	7	36814	36820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015697	A	6	6	36825	36830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015697	CAAT	2	8	36858	36865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015697	CAC	2	6	36867	36872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015697	AAG	2	6	36884	36889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015697	CAA	2	6	39045	39050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015697	A	7	7	39593	39599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015697	CTTT	2	8	41249	41256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015697	T	6	6	41346	41351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015697	A	7	7	41355	41361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015697	CTT	2	6	41427	41432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015697	TCT	2	6	41444	41449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015697	TCCT	2	8	43773	43780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015697	T	6	6	43782	43787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015697	ATTT	2	8	43804	43811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015697	GA	3	6	43832	43837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015697	TAA	2	6	43876	43881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015697	ATGA	2	8	43887	43894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015697	TTA	2	6	44605	44610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015697	AT	3	6	44798	44803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015697	A	6	6	44804	44809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015697	TAC	2	6	44842	44847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015697	ACT	2	6	44888	44893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015697	CAT	2	6	44953	44958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015697	CAC	2	6	44959	44964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015697	CTAT	2	8	45011	45018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015697	CACTTC	2	12	45094	45105	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015697	TCA	2	6	45119	45124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015697	ATCTC	2	10	45162	45171	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015697	CATA	2	8	45215	45222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015697	AAC	2	6	45247	45252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015697	ACG	2	6	45350	45355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015697	ACC	2	6	45545	45550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015697	CTGT	2	8	45585	45592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015697	AGG	2	6	45681	45686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015697	TGC	2	6	45738	45743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015697	GTA	2	6	45769	45774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015697	CCA	2	6	45777	45782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015697	CCTA	2	8	45821	45828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015697	ATTTCA	2	12	45924	45935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_015697	TC	3	6	45941	45946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015697	GCC	2	6	46038	46043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015697	GGCT	2	8	46194	46201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015697	TC	3	6	46265	46270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015697	TC	3	6	46285	46290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015697	ACT	2	6	46328	46333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015697	CCT	2	6	46484	46489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015697	CTCGGC	2	12	46559	46570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015697	GGA	2	6	46591	46596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015697	CCA	2	6	46688	46693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015697	CGC	2	6	46712	46717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015697	TGG	2	6	46840	46845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015697	AT	3	6	46904	46909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015697	GA	3	6	47105	47110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015697	TCC	2	6	47191	47196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_015697	CTT	2	6	47265	47270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_015697	CCG	2	6	47543	47548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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152	NC_015697	CAA	2	6	47674	47679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015697	TTG	2	6	47686	47691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_015697	TTTC	2	8	47738	47745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_015697	CTA	2	6	47757	47762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_015697	GCTA	2	8	47793	47800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_015697	TTAA	2	8	48016	48023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_015697	GT	3	6	48315	48320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015697	ATG	2	6	48509	48514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_015697	TCC	2	6	48535	48540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_015697	TTACC	2	10	49451	49460	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_015697	A	6	6	75018	75023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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